按照《國家稅務(wù)總局關(guān)于企業(yè)合并分立業(yè)務(wù)有關(guān)所得稅問題的通知》(國稅發(fā)2000119號)文件規(guī)定，企業(yè)合并的所得稅處理中，合并企業(yè)支付給被合并企業(yè)的非股權(quán)支付額不超過股權(quán)賬面價值20%的，經(jīng)稅務(wù)部門批準(zhǔn)，可以作為免稅合并處理，即被合并企業(yè)不確認(rèn)全部資產(chǎn)的轉(zhuǎn)讓所得或損失，不計算繳納所得稅。而且被合并企業(yè)以前年度的虧損，如果未超過法定彌補(bǔ)期限，可由合并企業(yè)繼續(xù)按規(guī)定用以后年度實(shí)現(xiàn)的與被合并企業(yè)資產(chǎn)相關(guān)的所得彌補(bǔ)。免稅免的是所得稅。
　　(1)應(yīng)稅合并
　　被合并企業(yè)：按照公允價值轉(zhuǎn)讓和處置資產(chǎn)，并繳納所得稅
　　合并企業(yè)：接受被合并企業(yè)的資產(chǎn)，計稅基礎(chǔ)為公允價值
　　同一控制會計處理：按賬面價值核算，產(chǎn)生遞延所得稅
　　非同一控制會計處理：按公允價值核算，不產(chǎn)生遞延所得稅
　　(2)免稅合并
　　合并企業(yè)：接受被合并企業(yè)的資產(chǎn)，計稅基礎(chǔ)為原賬面價值
　　被合并企業(yè)：不繳納所得稅
　　同一控制會計處理：按賬面價值核算，不產(chǎn)生遞延所得稅
　　非同一控制會計處理：按公允價值核算，產(chǎn)生遞延所得稅
　　如果是應(yīng)稅合并的話，非同一控制下的企業(yè)合并中，計稅基礎(chǔ)和賬面價值=公允價值，不存在暫時性差異，不產(chǎn)生遞延所得稅。