自2009年1月1日起，新增企業(yè)所得稅納稅人中，應繳納增值稅的企業(yè)，其企業(yè)所得稅由國稅局管理;應繳納營業(yè)稅的企業(yè)，其企業(yè)所得稅由地稅局管理。以2008年為基年，2008年底之前國稅局、地稅局各自管理的企業(yè)所得稅納稅人不作調整。
　　幾個特殊規(guī)定：
　　企業(yè)所得稅全額為中央收入的企業(yè)和在國稅局繳納營業(yè)稅的企業(yè)，其企業(yè)所得稅由國稅局管理;
　　跨地區(qū)經營匯總納稅企業(yè)新設立的分支機構，其所得稅的管理部門應與總機構企業(yè)所得稅管理部門相一致;
　　既不繳納增值稅、也不繳納營業(yè)稅的企業(yè)，暫由地稅局管理其企業(yè)所得稅;
　　既繳納增值稅、又繳納營業(yè)稅的企業(yè)，按主營稅種確定征管歸屬;無法確定主營業(yè)務的，以工商登記的*9項業(yè)務為準。