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財稅[2009]87號文規(guī)定，企業(yè)取得的2010年12月31日后的專用性財政性資金，只能由國務(wù)院財政、稅務(wù)主管部門規(guī)定專項用途并經(jīng)國務(wù)院批準(zhǔn)，才能準(zhǔn)予作為不征稅收入，在計算應(yīng)納稅所得額時從收入總額中減除。
除時限需注意外，如果是從縣級以上到?。ㄗ灾螀^(qū)、直轄市）級人民政府財政部門及其他部門取得的應(yīng)計入收入總額的財政性資金，也不能在繳納企業(yè)所得稅前扣除，除非財政部、國家稅務(wù)總局另有規(guī)定。
因此，從以上規(guī)定來看，財稅[2009]87號文比財稅[2008]151號文的規(guī)定對企業(yè)來講更有可操作性和可行性，即企業(yè)取得的專用性財政資金計入不征稅收入的條件放寬，并且可以免征企業(yè)所得稅。
案例分析
假設(shè)某企業(yè)發(fā)生5種與財政性資金有關(guān)的如下業(yè)務(wù)，則該企業(yè)相關(guān)稅務(wù)處理可按照如下方式進行。
企業(yè)發(fā)生的5種與財政性資金有關(guān)業(yè)務(wù)為：
1、從地方政府借款800萬元，需要按期付息，并在5年后還本；
2、企業(yè)取得了屬于三廢資源綜合利用900萬元增值稅退稅款；
3、地方某職能部門要求企業(yè)支付50萬元“集資修路費”，依據(jù)是縣政府的文件；
4、取得了地方政府用于幫助企業(yè)發(fā)展、購置固定資產(chǎn)、不需要償還的財政支持資金400萬元；
5、取得了由國務(wù)院財政、稅務(wù)主管部門規(guī)定專項用途，并經(jīng)國務(wù)院批準(zhǔn)的財政性資金300萬元。
政府借款不屬于應(yīng)稅收入
財政部、國家稅務(wù)總局《關(guān)于財政性資金、行政事業(yè)性收費、政府性基金有關(guān)企業(yè)所得稅政策問題的通知》（財稅[2008]151號）規(guī)定，企業(yè)取得的各類財政性資金，除屬于國家投資和資金使用后要求歸還本金的，均應(yīng)計入企業(yè)當(dāng)年收入總額。
其中，國家投資是指國家以投資者身份投入企業(yè)、并按有關(guān)規(guī)定相應(yīng)增加企業(yè)實收資本的直接投資。而“資金使用后歸還本金”要求應(yīng)該是地方政府的行為。如果對是否支付利息不作明確，只要求本金一定歸還，則屬于借款行為。
因此，這種行為與收入無關(guān)，不計入企業(yè)所得稅的應(yīng)稅收入額，增值稅退稅應(yīng)計入應(yīng)納稅所得額。
財稅[2008]151號強調(diào)，財政性資金是指企業(yè)取得的來源于政府及其有關(guān)部門的財政補助、補貼、貸款貼息，以及其他各類財政專項資 金，包括直接減免的增值稅和即征即退、先征后退、先征后返的各種稅收，但不包括企業(yè)按規(guī)定取得的出口退稅款。企業(yè)取得的各類財政性資金，除投資和借款以外，均應(yīng)計入企業(yè)當(dāng)年收入總額。
據(jù)此，該企業(yè)取得的三廢資源綜合利用900萬元增值稅退稅款，應(yīng)計入應(yīng)納稅所得額；取得的地方政府用于幫助企業(yè)發(fā)展、購置固定資產(chǎn)的財政支持資金400萬元，也應(yīng)計入應(yīng)納稅所得額。
“亂收費”項目不得稅前扣除
財稅[2008]151號指出，企業(yè)按照規(guī)定繳納的、由國務(wù)院或財政部批準(zhǔn)設(shè)立的政府性基金以及由國務(wù)院和省、自治區(qū)、直轄市人民政府及其財政和價格主管部門批準(zhǔn)設(shè)立的行政事業(yè)性收費，準(zhǔn)予在計算應(yīng)納稅所得額時扣除。企業(yè)繳納的不符合上述審批管理權(quán)限設(shè)立的基金、收費，不得在計算應(yīng)納稅所得額時扣除。
很明顯，該企業(yè)支付給地方某職能部門的50萬元“集資修路費”，依據(jù)是縣政府的文件，不屬上述審批權(quán)限規(guī)定的范疇，而屬于“亂收費”項目，所以不能在企業(yè)所得稅稅前扣除。
而事業(yè)單位因提供服務(wù)收取的經(jīng)營服務(wù)性收費，不屬于行政事業(yè)性收費，不受此項審批權(quán)限約束，可以在稅前扣除。
經(jīng)批準(zhǔn)的專項資金可視為不征稅收入
財稅[2008]151號要求，對企業(yè)取得的由國務(wù)院財政、稅務(wù)主管部門規(guī)定專項用途，并經(jīng)國務(wù)院批準(zhǔn)的財政性資金，準(zhǔn)予作為不征稅收入，在計算應(yīng)納稅所得額時從收入總額中扣除。
據(jù)此，該企業(yè)取得的由國務(wù)院財政、稅務(wù)主管部門規(guī)定專項用途，并經(jīng)國務(wù)院批準(zhǔn)的300萬元財政性資金應(yīng)作為不征稅收入，在計算應(yīng)納稅所得額時可以從收入總額中扣除。
需注意的是，這項規(guī)定是依據(jù)政府委托企業(yè)代辦某些公益事業(yè)的款項需有專門的用途而出現(xiàn)的。同時，應(yīng)滿足如下2個條件：
一是這類收入必須用于國務(wù)院財政、稅務(wù)主管部門規(guī)定的專項用途，不能混作他用；
二是批準(zhǔn)級別是國務(wù)院，由地方政府委托代行職能的專項資金不得作為不征稅收入，而應(yīng)視為應(yīng)稅收入
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