一、增值稅征管中的合法有效憑證
(一)增值稅進項稅額抵扣憑證的-般規(guī)定
根據(jù)《中華人民共和國增值稅暫行條例》的規(guī)定，準予從銷項稅額中抵扣的進項稅額，除購進免稅農(nóng)業(yè)產(chǎn)品準予抵扣的進項稅額外，僅限于下列增值稅扣稅憑證上注明的增值稅稅額：從銷售方取得的增值稅專用發(fā)票上注明的增值稅稅額；從海關(guān)取得的完稅憑證上注明的增值稅稅額。
(二)增值稅進項稅額抵扣憑證的幾項特殊規(guī)定
1.以收購憑證作為外購農(nóng)業(yè)產(chǎn)品和廢舊物資進項稅額的計算依據(jù)。根據(jù)《增值稅暫行條例實施細則》第十七條的規(guī)定，購進免稅農(nóng)業(yè)產(chǎn)品的買價，僅限于經(jīng)主管稅務機關(guān)批準使用的收購憑證上注明的價款。按照規(guī)定，以收購憑證上注明價款按13%計算進項稅額方準予抵扣。但針對一些農(nóng)業(yè)生產(chǎn)單位銷售自產(chǎn)農(nóng)產(chǎn)品可以開具普通發(fā)票的實際情況，為簡化手續(xù)，根據(jù)《關(guān)于增值稅若干征收問題的通知》(國稅發(fā)[1994]122號)規(guī)定，對一般納稅人購進農(nóng)業(yè)產(chǎn)品取得的普通發(fā)票，可以按普通發(fā)票上注明的價款計算進項稅額。從事廢舊物資經(jīng)營的增值稅一般納稅人收購的廢舊物資不能取得增值稅專用發(fā)票的，據(jù)經(jīng)主管稅務機關(guān)批準使用的收購憑證上注明的收購金額，依10%的扣除率計算進項稅額予以扣除。
2.普通發(fā)票作為運輸費用準予抵扣進項稅額的計算依據(jù)。從1994年5月1日起，對增值稅一般納稅人外購貨物(固定資產(chǎn)除外)所支付的運輸費用,根據(jù)運費結(jié)算單據(jù)(普通發(fā)票)所列運費金額依7%的扣除率計算進項稅額準予扣除，但隨同運費支付的裝卸費、保險費等其他雜費不得計入進項稅額予以扣除。從2003年11月1日起，提供貨物運輸勞務的納稅人須開具貨物運輸業(yè)發(fā)票，作為記賬憑證和增值稅抵扣憑證。
(三)對電力銷售、自來水銷售及商業(yè)零售企業(yè)使用專用發(fā)票的規(guī)定
對供電部門銷售電力、自來水公司銷售自來水，除銷售給普通消費者的以外，均需開具專用發(fā)票。對商業(yè)零售企業(yè)銷售商品凡向購買方開具專用發(fā)票的，必須按照《國家稅務總局關(guān)于增值稅專用發(fā)票使用問題的通知》(國稅明電[1994]35號)的規(guī)定.在購買方提供蓋有一般納稅人戳記的稅務登記證(副本)的前提下，銷貨方方可開具專用發(fā)票。
二、營業(yè)稅征管中的合法有效憑證
(一)營業(yè)額減除項目憑證
對營業(yè)額減除項目支付款項發(fā)生在境內(nèi)的，該減除項目支付款項憑證必須是發(fā)票或合法有效憑證；支付給境外的，該減除項目支付款項憑證必須是外匯付匯憑證，或外方公司的簽收單據(jù)、出具的公證證明。
(二)聯(lián)運業(yè)務憑證
對自開票納稅人開展的聯(lián)運業(yè)務，以其向貨主收取的運費及其他價外收費減去付給其他聯(lián)運合作方運費后的余額為營業(yè)額計算征收營業(yè)稅。
三、企業(yè)所得稅征管中的合法有效憑證
(一)將企業(yè)提供的完整、準確的收入及成本、費用憑證作為核定征收的重要依據(jù)。不能正確計算應納稅所得額的.稅務機關(guān)有權(quán)核定其應納稅所得額。
(二)將對關(guān)聯(lián)企業(yè)憑證的現(xiàn)場審計作為關(guān)聯(lián)企業(yè)業(yè)務往來調(diào)整的依據(jù)之一。在企業(yè)不能提供準確的價格、費用等憑證資料的情況下，可采取核定利潤率及其他合理方法進行調(diào)整。
(三)將相關(guān)憑證作為計算成本的根據(jù)。納稅人在經(jīng)營活動中發(fā)生的成本劃分為直接成本和間接成本。其中，直接成本可根據(jù)有關(guān)會計憑證、記錄直接計入有關(guān)成本計算對象或勞務的經(jīng)營成本中。
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