對財務(wù)報表進行分析，有助于我們?nèi)娴匕盐展镜呢攧?wù)情況和評估決策績效，但是也應(yīng)清醒地認識到財務(wù)報表分析的局限性：
首先，企業(yè)的資產(chǎn)以及利潤表中的產(chǎn)品銷售成本是按資產(chǎn)或存貨獲得時所支付的金額記錄的，因此資產(chǎn)和銷售成本不是按資產(chǎn)或存貨現(xiàn)行價值反映的。在通貨膨脹的情況下，有可能引起資產(chǎn)報酬率或權(quán)益報酬率的高估。另外，歷史成本的原則還導(dǎo)致同業(yè)新老企業(yè)比較的困難。
其次，會計方法選擇和會計估計的普遍存在。會計準(zhǔn)則和制度中常常允許對相同的業(yè)務(wù)采取多個可選擇的方法之一，即使對同類固定資產(chǎn)都采用直線法折舊，不同企業(yè)對資產(chǎn)的使用年限、使用年限未能夠在市場上可變賣的價值（殘值）的估計也可能是不一樣的。克服這些問題的方法有：其一，在企業(yè)集團內(nèi)部的績效考核之前，應(yīng)該按行業(yè)統(tǒng)一企業(yè)會計制度，盡可能地減少或甚至禁止對同一類經(jīng)濟業(yè)務(wù)的不同會計處理方法。其二，作為分析人員，應(yīng)采用一些剔除由于會計政策不一致對財務(wù)指標(biāo)的影響。
另外，財務(wù)指標(biāo)也具有局限性。企業(yè)的內(nèi)部控制程序是否有效以及企業(yè)作為組織的創(chuàng)新和學(xué)習(xí)能力怎樣等是財務(wù)指標(biāo)所不能反映或不能完全反映的，必須借助于其他的非財務(wù)指標(biāo)，甚至是難以量化的指標(biāo)來考核。
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