目前，出口企業(yè)支付國際海運費用有兩種情況：一是支付給貨物運輸代理公司，這是實務中最常見的方式;一是直接支付給從事國際遠洋運輸的公司，一般不多見。“營改增”試點后，出口貨物支付的國際運輸費用能否抵扣存在爭議。筆者認為，能否抵扣要根據費用收取方及開具的發(fā)票情況來判斷。
　　*9種取得的由貨物運輸代理公司開具的名為代理海運費的增值稅專用發(fā)票可以抵扣。相關企業(yè)財務人員甚至部分稅務干部對于貨物運輸代理公司開具的名為“代理海運費”的增值稅專用發(fā)票能否抵扣存有疑義，實際是源于慣性思維?！秶叶悇湛偩株P于增值稅一般納稅人支付的貨物運輸代理費用不得抵扣進項稅額的批復》(國稅函〔2005〕54號)規(guī)定，國際貨物運輸代理業(yè)務是國際貨運代理企業(yè)作為委托方和承運單位的中介人，受托辦理國際貨物運輸和相關事宜并收取中介報酬的業(yè)務。因此，增值稅一般納稅人支付的國際貨物運輸代理費用，不得作為運輸費用抵扣進項稅額。提醒大家注意的是，國稅函〔2005〕54號文中提到的是“不得作為運輸費用抵扣進項稅額”。
　　“營改增”試點后，貨物運輸代理公司與從事國際遠洋運輸的公司增值稅計稅方法不同，開具的發(fā)票也不同?！敦斦俊叶悇湛偩株P于在上海市開展交通運輸業(yè)和部分現(xiàn)代服務業(yè)營業(yè)稅改征增值稅試點的通知》(財稅〔2011〕111號，注：自2013年8月1日起廢止)對貨物運輸代理服務進行了詳細界定，自2013年8月1日起執(zhí)行的《財政部、國家稅務總局關于在全國開展交通運輸業(yè)和部分現(xiàn)代服務業(yè)營業(yè)稅改征增值稅試點稅收政策的通知》(財稅〔2013〕37號)，其附件1《交通運輸業(yè)和部分現(xiàn)代服務業(yè)營業(yè)稅改征增值稅試點實施辦法》第十二條第三款規(guī)定，提供現(xiàn)代服務業(yè)服務(有形動產租賃服務除外)，稅率為6%。第十三條規(guī)定，增值稅征收率為3%。在應稅服務范圍注釋中規(guī)定，貨物運輸代理服務屬于“部分現(xiàn)代服務業(yè)”中的“物流輔助服務”，并對貨物運輸代理服務進行了更全面的定義。即接受貨物收貨人、發(fā)貨人、船舶所有人、船舶承租人或船舶經營人的委托，以委托人的名義或者以自己的名義，在不直接提供貨物運輸服務的情況下，為委托人辦理貨物運輸、船舶進出港口、聯(lián)系安排引航、靠泊、裝卸等貨物和船舶代理相關業(yè)務手續(xù)的業(yè)務活動。既然貨物運輸代理服務是應稅服務，增值稅的計算方法包括一般計稅方法和簡易計算方法，并可以開具增值稅專用發(fā)票，只要認證比對無誤就可以抵扣。
 
　　案例1
　　某公司2013年8月出口一批燈具，報關單上顯示成本加運費價(C&F)為20000美元，其中海運費200美元，匯率為1：6.4，運費取得貨代公司開具的增值稅專用發(fā)票(金額為1207.55元，稅額為72.45元)已通過銀行付款，發(fā)票認證比對無誤，8月作如下會計處理：
　　借：其他應付款 1207.55
　　應交稅費——應交增值稅(進項稅額) 72.45
　　貸：銀行存款 1280
　　借：應收賬款 128000
　　貸：主營業(yè)務收入 126792.45
　　其他應付款 1207.55。
　　公司賬上確認的出口收入是126792.45元。在出口退稅申報時，由于應按離岸價(FOB)申報，公司在出口退稅申報表申報出口收入20000×6.4-1207.55=126792.45(元)。
　　第二種取得的由從事國際遠洋運輸的公司開具的名為海運費的發(fā)票不存在抵扣的問題。自2013年8月1日起執(zhí)行的財稅〔2013〕37號文件附件4《應稅服務適用增值稅零稅率和免稅政策的規(guī)定》*9條規(guī)定，中華人民共和國境內(以下稱境內)的單位和個人提供的國際運輸服務、向境外單位提供的研發(fā)服務和設計服務，適用增值稅零稅率。第四條規(guī)定，境內的單位和個人提供適用零稅率的應稅服務，如果屬于適用增值稅一般計稅方法的，實行免抵退稅辦法，退稅率為其按照試點實施辦法第十二條第(一)至(三)項規(guī)定適用的增值稅稅率;如果屬于適用簡易計稅方法的，實行免征增值稅辦法。外貿企業(yè)兼營適用零稅率應稅服務的，統(tǒng)一實行免退稅辦法。既然適用免抵退稅或免征增值稅辦法，自然無法開具增值稅專用發(fā)票，因此，從事國際遠洋運輸業(yè)務的公司開具的海運費發(fā)票，不存在抵扣的問題。
 
　　案例2
　　某公司2013年8月出口一批燈具，報關單上顯示C&F價為20000美元，其中海運費200美元，匯率為1：6.4，取得從事國際遠洋運輸業(yè)務的公司開具名為海運費的普通發(fā)票，已通過銀行付款。8月作如下會計處理：
　　借：其他應付款 1280
　　貸：銀行存款 1280
　　借：應收賬款 128000
　　貸：主營業(yè)務收入 126720
　　其他應付款 1280。
　　公司賬上確認的出口收入是126720元。在出口退稅申報時，由于應按FOB價申報，公司在出口退稅申報表申報出口收入(20000-200)×6.4=126720(元)。