南京中醫(yī)藥大學始建于1954年，是中國建校最早的高等中醫(yī)藥院校之一，是教育部和江蘇省共建的國家“世界一流學科建設高?！?，是教育部、江蘇省人民政府與國家中醫(yī)藥管理局三方共建高校[1]、江蘇省重點建設高校、江蘇省高水平大學建設高校，是世界一流中醫(yī)藥大學建設聯盟、長三角醫(yī)學教育聯盟創(chuàng)始成員，是世界衛(wèi)生組織（WHO）傳統(tǒng)醫(yī)學合作中心、國家衛(wèi)生部確定的國際針灸培訓中心、全國首批博士和碩士學位授權單位、全國古籍重點保護單位、全國中醫(yī)師資進修教育基地、國家建設高水平大學公派研究生項目實施高校、國家“特色重點學科項目”建設高校、國家“卓越醫(yī)生（中醫(yī)）教育培養(yǎng)計劃”改革首批試點高校、國家級人才培養(yǎng)模式創(chuàng)新實驗區(qū)、中國政府獎學金來華留學生接收院校。
截至2019年9月，學校有33個本科專業(yè)；擁有4個一級學科及1個專業(yè)學位博士學位授權點，11個一級學科碩士學位及5個專業(yè)碩士學位授權點，3個博士后科研流動站；有各類在校生2萬余名。截至2020年7月，學校有仙林、漢中門、泰州3個校區(qū)。