企業(yè)年金個人所得稅一般指關(guān)于企業(yè)年金職業(yè)年金個人所得稅有關(guān)問題的通知，關(guān)于企業(yè)年金職業(yè)年金個人所得稅有關(guān)問題的通知是指企業(yè)和事業(yè)單位（以下統(tǒng)稱單位）根據(jù)國家有關(guān)政策規(guī)定的辦法和標(biāo)準(zhǔn)，為在本單位任職或者受雇的全體職工繳付的企業(yè)年金或職業(yè)年金（以下統(tǒng)稱年金）單位繳費部分，在計入個人賬戶時，個人暫不繳納個人所得稅。
一、企業(yè)年金如何繳納個稅？
根據(jù)《企業(yè)年金試行辦法》（中華人民共和國勞動和社會保障部令第20號）第二條規(guī)定：本辦法所稱企業(yè)年金，是指企業(yè)及其職工在依法參加基本養(yǎng)老保險的基礎(chǔ)上，自愿建立的補充養(yǎng)老保險制度?！敦斦?國家稅務(wù)總局關(guān)于補充養(yǎng)老保險費補充醫(yī)療保險費有關(guān)企業(yè)所得稅政策問題的通知》（財稅【2009】27號）自2008年1月1日起，企業(yè)根據(jù)國家有關(guān)政策規(guī)定，為在本企業(yè)任職或者受雇的全體員工支付的補充養(yǎng)老保險費、補充醫(yī)療保險費，分別在不超過職工工資總額5%標(biāo)準(zhǔn)內(nèi)的部分，在計算應(yīng)納稅所得額時準(zhǔn)予扣除；超過的部分，不予扣除。
綜上所述，該公司為員工發(fā)放的企業(yè)年金能稅前扣除，扣除比例是不超過職工工資總額5%標(biāo)準(zhǔn)內(nèi)的部分。
二、企業(yè)年金個人所得稅如何計算？
1、關(guān)于年金，主要是針對企業(yè)繳納的部分，要依法計算個稅，但是不是加入工資計稅，而是單獨計算個稅。
具體規(guī)定如下：企業(yè)年金的企業(yè)繳費計入個人賬戶的部分：
（1）按月繳納企業(yè)繳費的，視為個人一個月的工資、薪金（不與正常工資、薪金合并），不扣除任何費用，按照“工資、薪金所得”項目計算當(dāng)期應(yīng)納個人所得稅款，并由企業(yè)在繳費時代扣代繳。應(yīng)納稅額＝年金的企業(yè)繳費×適用稅率－速算扣除數(shù)
（2）對企業(yè)按季度、半年或年度繳納企業(yè)繳費的，在計稅時不得還原至所屬月份，均作為一個月的工資、薪金，不扣除任何費用，按照適用稅率計算扣繳個人所得稅。
2、企業(yè)年金的企業(yè)繳費部分計入職工個人賬戶時，當(dāng)月個人工資薪金所得與計入個人年金賬戶的企業(yè)繳費之和未超過個人所得稅費用扣除標(biāo)準(zhǔn)的，不征收個人所得稅。
3、個人當(dāng)月工資薪金所得低于個人所得稅費用扣除標(biāo)準(zhǔn)，但加上計入個人年金賬戶的企業(yè)繳費后超過個人所得稅費用扣除標(biāo)準(zhǔn)的，其超過部分按規(guī)定繳納個人所得稅。
另外，你單位目前尚未建立個人賬戶，只是在賬面反映該項目，暫不需要計算繳納個稅，個稅是在員工取得所得時才扣繳的。
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