問：我公司與日本企業(yè)簽訂了多項咨詢合同，其中部分合同的執(zhí)行地在外省，但是付匯地在我公司所在地。按照規(guī)定應(yīng)該在項目執(zhí)行地繳納所得稅，但是目前有一個合同在公司所在地主管國稅局繳納了預(yù)提所得稅，項目所在地的稅務(wù)機關(guān)是否會認為我公司偷稅漏稅？已經(jīng)繳納的預(yù)提所得稅能否辦理退稅？
答：《國家稅務(wù)總局關(guān)于印發(fā)〈非居民企業(yè)所得稅源泉扣繳管理暫行辦法〉的通知》（國稅發(fā)[2009]3號）第三條規(guī)定，對非居民企業(yè)取得來源于中國境內(nèi)的股息、紅利等權(quán)益性投資收益和利息、租金、特許權(quán)使用費所得、轉(zhuǎn)讓財產(chǎn)所得以及其他所得應(yīng)當(dāng)繳納的企業(yè)所得稅，實行源泉扣繳，以依照有關(guān)法律規(guī)定或者合同約定對非居民企業(yè)直接負有支付相關(guān)款項義務(wù)的單位或者個人為扣繳義務(wù)人。
第七條規(guī)定，扣繳義務(wù)人在每次向非居民企業(yè)支付或者到期應(yīng)支付本辦法第三條規(guī)定的所得時，應(yīng)從支付或者到期應(yīng)支付的款項中扣繳企業(yè)所得稅。
本條所稱到期應(yīng)支付的款項，是指支付人按照權(quán)責(zé)發(fā)生制原則應(yīng)當(dāng)計入相關(guān)成本、費用的應(yīng)付款項。
第十五條第三款規(guī)定，扣繳義務(wù)人所在地與所得發(fā)生地不在一地的，扣繳義務(wù)人所在地主管稅務(wù)機關(guān)應(yīng)自確定扣繳義務(wù)人未依法扣繳或者無法履行扣繳義務(wù)之日起5個工作日內(nèi)，向所得發(fā)生地主管稅務(wù)機關(guān)發(fā)送《非居民企業(yè)稅務(wù)事項聯(lián)絡(luò)函》，告知非居民企業(yè)的申報納稅事項。
第十六條規(guī)定，非居民企業(yè)依照本辦法第十五條規(guī)定申報繳納企業(yè)所得稅，但在中國境內(nèi)存在多處所得發(fā)生地，并選定其中之一申報繳納企業(yè)所得稅的，應(yīng)向申報納稅所在地主管稅務(wù)機關(guān)如實報告有關(guān)情況。申報納稅所在地主管稅務(wù)機關(guān)在受理申報納稅后，應(yīng)將非居民企業(yè)申報繳納所得稅情況書面通知扣繳義務(wù)人所在地和其他所得發(fā)生地主管稅務(wù)機關(guān)。
根據(jù)上述規(guī)定，對非居民企業(yè)取得來源于中國境內(nèi)咨詢服務(wù)其他所得，以依照合同約定對非居民企業(yè)直接負有支付相關(guān)款項義務(wù)的單位（付匯地在居民企業(yè)所在地）為扣繳義務(wù)人，應(yīng)從支付或者到期應(yīng)支付的款項中扣繳企業(yè)所得稅。需要注意的，在中國境內(nèi)存在多處所得發(fā)生地，應(yīng)向居民企業(yè)申報納稅所在地主管稅務(wù)機關(guān)如實報告有關(guān)情況。申報納稅所在地主管稅務(wù)機關(guān)在受理申報納稅后，應(yīng)將非居民企業(yè)申報繳納所得稅情況書面通知扣繳義務(wù)人所在地和其他所得發(fā)生地主管稅務(wù)機關(guān)。